Sistem WCS bertanggung jawab atas penjadwalan antara sistem dan peralatan, dan mengirimkan perintah yang dikeluarkan oleh sistem WMS ke setiap peralatan untuk operasi terkoordinasi. Ada komunikasi berkelanjutan antara peralatan dan sistem WCS. Ketika peralatan menyelesaikan tugasnya, sistem WCS secara otomatis melakukan posting data dengan sistem WMS.